DNA甲基化已成為癌癥研究中一個很有前途的生物標志物。然而,確定臨床相關(guān)生物標志物的準確基因組位置仍然是一項具有挑戰(zhàn)性的任務(wù),阻礙了癌癥DNA甲基化生物標志物在臨床上的應(yīng)用。整合癌癥相關(guān)WGBS數(shù)據(jù)為精確識別這些生物標志物提供了一種很有前途的方法。隨著癌癥DNA甲基化生物標志物研究的快速進展,癌癥相關(guān)WGBS數(shù)據(jù)的可用性急劇增加。然而,目前沒有專門的資源癌癥DNA甲基化生物標志物WGBS數(shù)據(jù)。
MethMarkerDB,一個用戶友好、可訪問的數(shù)據(jù)庫,集成了724個DNA甲基化生物標志物基因,并包含來自PubMed上發(fā)表的文章和廣泛的全基因組DNA甲基化測序(WGBS)數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫提取了這些生物標志物基因中真正具有功能的差異甲基化區(qū)域(DMR),并進行了精細的分析、整合和呈現(xiàn)。它包含了基于文獻的基因標記、DMR標記以及診斷和預(yù)后評估功能,為研究人員提供了強大的工具,以更好地了解和利用癌癥DNA甲基化生物標志物。
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