人類基因組序列的完成使人們能夠通過使用計(jì)算方法快速識(shí)別和分析感興趣的基因。因此,包括已知腫瘤相關(guān)基因的物理特征和功能域在內(nèi)的注釋可用于研究參與致癌作用基因的研究。
腫瘤相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù)旨在利用來(lái)自特征明確的致癌基因和抑癌基因的信息來(lái)促進(jìn)癌癥研究。所有靶基因都是通過PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的文本篩選方法識(shí)別,建立了一個(gè)半自動(dòng)信息檢索引擎,從各種資源中收集這些靶基因的特定信息并存儲(chǔ)在TAG數(shù)據(jù)庫(kù)中。目前,TAG數(shù)據(jù)庫(kù)收集了662個(gè)腫瘤相關(guān)基因,包括246個(gè)致癌基因、265個(gè)抑癌基因和151個(gè)與致癌相關(guān)的基因。
Text Search
在搜索框輸入感興趣的基因名稱,點(diǎn)擊“Run”進(jìn)行搜索:
在結(jié)果頁(yè)面選擇想要進(jìn)一步查看的結(jié)果,點(diǎn)擊最下方的“Run Consensus Analysis”可以進(jìn)行分析:
分析結(jié)果包括基因/蛋白信息,基因GO分析結(jié)果:
List by Chromosome
選擇感興趣的染色體,即可查看該染色體上所有腫瘤相關(guān)基因的信息:
點(diǎn)擊結(jié)果頁(yè)面任一基因可以查看該基因的詳細(xì)信息: